Применение генных сетей к анализу результатов метаболомного скрининга плазмы крови пациентов с послеоперационным делирием

Применение генных сетей к анализу результатов метаболомного скрининга плазмы крови пациентов с послеоперационным делирием Научная публикация

Журнал

Вавиловский журнал генетики и селекции/Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii
ISSN: 2500-0462 , E-ISSN: 2500-3259

Вых. Данные

Год: 2023, Том: 27, Номер: 7, Страницы: 768-775 Страниц : 8 DOI: 10.18699/vjgb-23-89

Ключевые слова

ВЭЖХ-МС/МС; метаболомика; липидомика; послеоперационный делирий; кардиохирургия; биомаркеры; сфинголипиды; генные сети; ANDSystem.

Авторы

Иванисенко В.А. ^1,2,7 , Басов Н.В. ^2,3 , Макарова А.А. ¹ , Вензель А.С. ^1,7 , Рогачев А.Д. ^2,3 , Деменков П.С. ^1,2,7 , Иванисенко Т.В. ^1,2,7 , Клещев М.А. ¹ , Гайслер Е.В. ^2,3 , Мороз Г.Б. ⁴ , Плеско В.В. ⁴ , Сотникова Ю.С. ^2,3,5 , Патрушев Ю.В. ^2,5 , Ломиворотов В.В. ^4,6 , Колчанов Н.А. ^1,2 , Покровский А.Г. ²

Организации

1	Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук
2	Новосибирский национальный исследовательский государственный университет
3	Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова СО РАН
4	Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина»
5	ФИЦ «Институт катализа им. Г.К. Борескова СО РАН
6	Penn State College of Medicine, Hershey, PA, United States
7	Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Информация о финансировании (1)

Российский Научный Фонд

22-23-01068

Послеоперационный делирий (ПОД) является серьезным осложнением, приводящим к нару- шению когнитивных функций пациентов, увеличению длительности госпитализации, а также повышению расходов на лечение пациента. Проблема ранней диагностики ПОД приобретает особую важность в случае кардиохирургических операций, поскольку частота развития такого осложнения у некоторых категорий пациентов превышает 50 %. Известно, что в развитие ПОД большой вклад вносят нейровоспаление, дисба- ланс нейромедиаторов, нарушение нейроэндокринной регуляции и межнейрональных связей, однако мо- лекулярно-генетические механизмы ПОД у пациентов, перенесших кардиохирургические операции, а также метаболомные диагностические маркеры, до сих пор плохо изучены. В данной работе с помощью метода высокоэффективной жидкостной хроматографии с масс-спектрометрической детекцией (ВЭЖХ-МС/МС) был проведен анализ содержания ряда сфингомиелинов в плазме крови пациентов старше 65 лет, взятой после операции на сердце в условиях искусственного кровообращения. Найдено четыре статистически значимо различающихся по содержанию сфингомиелина у пациентов с ПОД по сравнению с пациентами, у которых не развился ПОД (контрольная группа). С помощью реконструкции генных сетей, описывающих генетиче- скую регуляцию пути метаболизма сфинголипидов, определены 82 регуляторных белка, из которых 47 – ре- гуляторы экспрессии генов, кодирующих ферменты метаболического пути, и 35 – регуляторы активности, деградации и транспорта ферментов данного пути. Анализ перепредставленности заболеваний, с которыми ассоциированы эти регуляторные белки, показал, что регуляторы можно разбить на две группы, ассоции- рованные с сердечно-сосудистыми патологиями и с нервно-психическими заболеваниями соответственно. Регуляторы, ассоциированные с сердечно-сосудистыми патологиями, ожидаемо связаны с воздействием на ткани миокарда во время операции. Сделано предположение, что нарушение функции регуляторов, ассоции- рованных с нервно-психическими заболеваниями, может специфически обусловливать развитие ПОД после кардиохирургической операции. Таким образом, выявленные регуляторные гены могут представлять основу для планирования дальнейших экспериментов по изучению нарушений на уровне экспрессии данных генов, а также нарушения функции кодируемых ими белков у пациентов с ПОД. Идентифицированные значимые сфинголипиды могут рассматриваться как потенциальные маркеры послеоперационного делирия.

Иванисенко В.А. , Басов Н.В. , Макарова А.А. , Вензель А.С. , Рогачев А.Д. , Деменков П.С. , Иванисенко Т.В. , Клещев М.А. , Гайслер Е.В. , Мороз Г.Б. , Плеско В.В. , Сотникова Ю.С. , Патрушев Ю.В. , Ломиворотов В.В. , Колчанов Н.А. , Покровский А.Г.
Применение генных сетей к анализу результатов метаболомного скрининга плазмы крови пациентов с послеоперационным делирием
Вавиловский журнал генетики и селекции/Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 2023. Т.27. №7. С.768-775. DOI: 10.18699/vjgb-23-89 WOS РИНЦ OpenAlex

Поступила в редакцию:	21 июл. 2023 г.
Опубликована в печати:	24 авг. 2023 г.

Web of science:	WOS:001140097800006
РИНЦ:	56697257
OpenAlex:	W4389624098

БД	Цитирований
OpenAlex	8
Web of science	6
РИНЦ	5